Dort arbeitet er hauptsächlich auf dem Gebiet der Evolution von Planetenatmosphären. Lammer absolvierte zahlreiche Forschungsaufenthalte in mehreren europäischen Ländern und Russland. Er ist an den Weltraummissionen „Mars Express“, der ersten europäischen Venus-Raumsonde „Venus Express“, sowie der Merkurmission „BepiColombo“ und den Exoplanetenmissionen „COROT“ und „CHEOPS“ beteiligt. Außerdem gehört Lammer wissen- schaftlichen Beraterteams der europäischen Raumfahrtbehörde ESA an, die sich mit Sonnensystemmissionen und den Missionen Darwin/TPF (Terrestrial Planet Finder) zur Entdeckung erdähnlicher Exoplaneten beschäftigen.