2018年广州市输入型登革病毒3型基因组全序列测定和特征分析

目的 分析广州市2018年输入型登革热病毒3型(DENV-Ⅲ)毒生物学来源,为本地登革热防控提供科学依据和基线数据.方法 通过传染病监测网络收集广州市2018年输入型DENV-Ⅲ病例,对患者急性期血清进行病毒分离培养、全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析.结果 共分离到4株DENV-Ⅲ型毒株,株间核苷酸(氨基酸)同源性为91.8％～97.3％(97.6％～99.4％);泰国输入的分离株属于G-Ⅰ型,与印度尼西亚2016年分离株的距离最近;其余3株分离株属于G-Ⅲ型,在进化树上处于同一分支,分别与老挝、巴基斯坦和新加坡分离株的距离最近;经过比对,4株分离株和13株参考株的E蛋白区域有18个氨基酸位点出现替换,NS1蛋白区域有7个氨基酸位点出现替换,NS5蛋白区域有21个氨基酸位点出现替换.结论 广州市2018年输入型DENV-Ⅲ毒株分属于2个不同的基因型亚群,在进化上距离较远,抗原性差异较大;通过全基因组测序和特征分析,逐步完善周边地区的病毒特征信息,为防控工作提供生物学溯源依据,具有重要意义.